O Ensino Médio do Colégio Independência visa aprimorar a formação moral, social, intelectual e crítica tornando o aluno cidadão pleno, consciente do seu papel na sociedade.
O aluno tem sua autoconfiança e iniciativa estimuladas, tornando-o apto para enfrentar o vestibular e o mercado de trabalho.
No último ano do Ensino Médio, os alunos revisam todo o conteúdo programático, e realizam simulados bimestrais, no estilo das provas da UFRJ, UERJ, UFF e outras.